全樣本空間全轉(zhuǎn)錄組——你的空間轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)夠“全”嗎?
全樣本空間全轉(zhuǎn)錄組——你的空間轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)夠“全”嗎?答案是不夠,但M20 Spatial技術(shù)正在改變這一現(xiàn)狀。
空間轉(zhuǎn)錄組學(xué)相比原來的單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組學(xué),增加了空間信息,從而增加了更多的整合任務(wù)。具體而言,分為以下四類:整合相同樣本/不同樣本的鄰近切片 相同樣本鄰近切片整合:通過算法將同一樣本的不同鄰近切片上的數(shù)據(jù)融合在一起,進行統(tǒng)一的聚類分群。
測序方案:新鮮樣本空間轉(zhuǎn)錄組、石蠟樣本空間轉(zhuǎn)錄組、免疫組化技術(shù)、多重免疫熒光。主要結(jié)果:使用空間轉(zhuǎn)錄組學(xué)技術(shù)揭示了TLS中B細(xì)胞的反應(yīng),包括克隆多樣化、選擇、擴增等過程。發(fā)現(xiàn)TLS+腫瘤中產(chǎn)生了較多的漿細(xì)胞(Ig介導(dǎo)產(chǎn)生)、IgG以及凋亡惡性細(xì)胞,這表明抗腫瘤效應(yīng)的活性。

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